Te aconsejo lo contrario, eliminar por completo toda la silicona, para ello utiliza un trapo limpio, empápalo completamente en alcohol y limpia todas las zonas en las que haya contacto de las gomas con la chapa metálica.
La explicación es fácil, las puertas cuando circulamos por una zona irregular tiene un cierto movimiento de arriba a abajo, si las gomas están enceradas o con silicona, la hoja resbala por encima de la chapa cada vez que la puerta se mueve de arriba a abajo, cuando lo limpiamos todo con el alcohol y retiramos la silicona, las gomas se quedan cogidas a presión sobre la chapa y no suben ni bajan simplemente se deforman pero sin deslizarse como sucede cuando están con silicona.
Si se trata del mismo problema del mío, esta limpieza hará desaparecer el ruido, en mi caso, después de muchas pruebas fue la solución definitiva.