Prueba este remedio, en mi caso después de muchas diferentes pruebas, tiempo y dolor de cabeza, ha sido “mano de santo” limpiar todas las gomas con un trapo empapado en alcohol, ese ruidito, por lo que entiendo, es debido a que cuando alguna pieza, cristal o plancha, esta presionando sobre cualquiera de las gomas y está tiene algo de silicona, o restos, en lugar de quedarse fijada esa goma contra el cristal o contra la plancha de la puerta, esa silicona le permite moverse y al hacerlo, cuando coges algo de zona bacheada, en la que el coche da pequeños saltitos de arriba a abajo, produce esos pequeños ruidos.
No te mareo más, no es fácil de explicar por escrito, pero prueba a limpiar con alcohol la zona de las gomas de las puertas, todas, y la zona de chapa o cristal que esté en contacto con esas gomas, yo lo hice así y desaparecieron todos los ruiditos.